蚌埠医学院创建于1958年7月，由原上海第二医学院分迁和安徽医学院援建而成，是安徽省省属普通高等医学本科院校和国家首批具有学士和硕士学位授予权的单位，是山东大学、第三军医大学博士研究生联合培养单位，是安徽省院士工作站和博士后岗位设置单位，是国家第一批卓越医生教育培养计划试点高校、国家级大学生创新创业实践基地和校外实践基地，是教育部临床医学“5+3”改革试点高校、医学检验技术专业综合改革试点高校和临床技能综合培训中心。
学校坐落于享有“禹风厚德、孕沙成珠”美誉的重要交通枢纽城市——蚌埠，占地面积近1000亩，总建筑面积达33万平方米，是一所功能齐全、环境优美，集智能化、生态化、数字化为一体的省级园林式单位和绿化模范单位。
学校遵循“以医为主、以本为主、以人为本、以质为本”的办学理念，形成了医学、理学、工学、管理学4个学科门类协调发展的教育格局。现有本科专业（含专业方向）18个（临床医学、医学检验技术、护理学、医学影像学、药学、预防医学、生物科学、精神医学、食品卫生与营养学、信息管理与信息系统、口腔医学、制药工程、药物分析、医学影像技术、生物技术、全科医学、麻醉学、临床输血）；有基础医学、临床医学和护理学3个一级学科硕士学位授权点，临床医学、公共卫生和口腔医学3个硕士专业学位授权点，29个二级学科授权点。
学校面向全国18个省市招生，现有普教本科在校生近13000名，硕士研究生近1000名。校本部和直属附属医院共有教职医护员工近4000人，其中副高以上专业技术人员771人，教授、副教授340人。有全国优秀教师6人，全国和省五一劳动奖章获得者3人；省模范教师、优秀教师、先进工作者16人。有省学术和技术带头人及后备人选17人；省教育厅拔尖人才、省高校中青年学科带头人培养对象15人，省高校中青年骨干教师38人。享受国务院、省政府特殊津贴的专家54人。
学校拥有1个国家级特色专业，7个省级特色专业，5个省级综合改革试点专业，9个省级重点学科、特色专科，3个省级重点实验室，1个省级工程技术中心，1个省人文社科重点研究基地，1个省级产学研战略联盟，2个省级实验教学示范中心，2个省级人才培养模式创新实验区。公开出版发行《蚌埠医学院学报》、《中华解剖与临床杂志》、《中华全科医学》3种学术刊物。拥有国家心理咨询师职业资格鉴定考试点，公共营养师国家职业技能鉴定站，育婴师、养老护理员国家职业技能鉴定站。
近年来，学校发挥高校科研优势，积极承担国家自然科学基金项目30余项，教育部、卫生部各类课题项目10余项，获省厅级以上科研立项600余项，申报发明专利10余项，合作参与了包括国家重大科技专项973项目在内的国家级项目10余项，发表各类论文6000余篇，出版教材、专著50余部。曾获安徽省科技进步一等奖3项，卫生部科技进步二等奖2项。
学校有2所直属附属医院。第一附属医院是皖北地区规模最大的综合性医院，是卫生部首批三级甲等医院。拥有1个国家级临床重点专科，1个国家中医“十二五”重点专科，4个省级临床医学重点专科，6个省级重点培育专科，3个省高校重点学科，2个省级重点实验室，拥有安徽省首个肺癌综合诊疗中心和骨关节病综合诊疗中心。实际开放床位2400余张。第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的省直三级甲等医院，实际开放床位近1000张，是“全国百姓放心示范医院”、省新农合工作“优秀医院”。医院有一批省级和校级特色学科和专科，技术力量雄厚，设备先进，服务优质，深受群众信赖。医院检验科被国家卫生部临床检验中心授予“全国优秀实验室”称号。2016年，占地300余亩、3000张床位的省重点项目——第二附属医院新院将矗立在淮河岸边，为皖北千万人民的身心健康保驾护航。
学校另有11所非直属附属医院，170多家教学医院、实习医院和实习基地，主要分布在北京、上海等9个省市。
学校牢牢把握“有扎实的理论基础、较强的动手能力、具有一定发展后劲”的人才培养目标定位，高度重视学生临床技能的培养，在附属医院和教学医院中稳步推行“临床学院教学模式”改革，有效破解了临床教学资源短缺难题。积极探索课堂教学和临床见习融通的“一体化”教学模式，使学生真正能够早接触临床、多接触临床和反复接触临床，达到了提高临床实践技能和人才培养质量的目的。2012—2014年，学校连续三年进入全国高等医学院校大学生临床技能竞赛总决赛，并蝉联二等奖以上奖项。在2013年首届全国医学影像专业大学生实践技能大赛中，荣获大赛团体特等奖。学校毕业生以基础理论扎实，动手能力强赢得社会的广泛赞誉，用人单位问卷调查总体满意度达100%，连续多年毕业生就业率保持在较高水平。
学校积极开展国内外学术交流活动，先后与美、法、德、日、澳等国学术机构、院校建立了协作关系。2008年在亚洲五国招收留学生69人。
建校至今，一代代蚌医人秉承“笃学、精业、修德、厚生”的校训，孕育铸就了“艰苦创业、严谨治学、精诚为医、团结奉献”的蚌医精神，潜心耕耘、知难而进、励精图治、德业日新。学校培养出包括中国工程院院士刘德培、中国科学院院士段树民在内的各级各类医学专门人才五万余名，为我国的医药卫生事业和经济社会发展做出了重要贡献。在新的历史条件下，学校将秉承优良传统，描绘新的发展蓝图，锐意进取，继往开来，向建设特色鲜明的高水平医科大学的目标迈进！（2014年10月更新）